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5cm）。この病態は通常生後すぐに認識される。 小陰茎症という言葉は、陰茎、陰嚢、会陰の残りの部分に尿道下裂などの曖昧さがない場合に医学的に最もよく用いられる。患者の割合は成人男性の約0.6%を占める。矮小陰茎とも呼ばれる。似たような症状に埋没陰茎と言うのがあり、こちらは陰茎が恥骨付近の皮下脂肪に埋もれて、小さく見えている状態は埋没陰茎に分類される。
は大腸菌である。反復感染する場合は、尿路系の先天性奇形の存在や、尿路異物の存在を疑う。 勃起状態の陰茎に無理な力が加わると、海綿体を包んでいる白膜（陰茎海綿体薄膜）などが断裂する事があり、これを陰茎折症という。 半陰陽や、尿道下裂などが知られる。 包皮を反転させて亀頭を露出させることが不可能な場合を
陰茎癌（いんけいがん、英語: Penile cancer）は、陰茎の皮膚や組織内に発症する癌腫（悪性腫瘍）である。主に亀頭や包皮から発生する。オーストラリアで、発症率は年間25万人に1人である。アメリカで、発症率は年間10万人に1人である。デンマークで、発症率は年間10万人に0
いる、と考えられている。たとえば、枝分かれした半陰茎を持つ種のメスは枝分かれした総排出腔を持ち、多くの棘を持つ種のメスは棘が少ないか無い種より総排出腔壁が厚い。この有鱗目における外部生殖器の大きな変異は分類学者の興味を引き、爬虫類間の進化上の関係について光を当てる可能性がある。
食肉類、霊長類、真無盲腸類、翼手類、齧歯類などのグループのうち多くの種 有袋類、単孔類、ゾウ目、ジュゴン目、鯨偶蹄目、ウマ目、ウサギ目（例外的にアメリカナキウサギにはある）には陰茎骨がない。また、霊長類の一部（ヒト、クモザル属、メガネザル属など）、食肉目の一部（ジャコウネコ科の一部、ハイエナ科）、翼手類の一部なども陰茎骨を持たない。
表面は唇の皮膚と同様に粘膜質でできている。一般的に男性の身体で最も敏感な性感帯である。女性の陰核亀頭に相当する部分である。色はピンク色が一般的ではあるが、割礼の有無、気温、性的興奮状態などの環境により、静脈血由来の灰青色を呈したり、逆に赤紫色に近い色にも変化する。先端には尿道口があり、末端のつけ根に沿って陰茎亀頭冠がある。皮膚は他の部分
かつては早漏の治療として、手術で陰茎小帯を切断することも行われていたが、切断によっても性感の低下がまったく、あるいはほとんど見られないため、現在では早漏治療としての陰茎小帯切断手術は施されていない。治療として陰茎小帯切断手術を施すのは、包皮反転時にこの部分が張り過ぎて性交時に相当な痛みを感じ、性交に支障が生じる場合である。
陰茎包皮（いんけいほうひ、英: Foreskin, 羅: Praeputium）とは一般的に、陰茎が勃起していない状態の際に亀頭を覆い尿道を保護する、伸縮性の二重になった皮膚および粘膜である。陽の皮、陽皮とも呼ばれる。陰茎包皮と相同である、女性における陰核包皮も含めた幅広い用語として包皮とも呼ばれる。
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