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ち、佐賀県が管理する二級水系を記述する。2005年（平成17年）3月現在、60水系、174河川ある。 リストの順序は、有明海沿岸を北東から南西へ、玄海灘沿岸を西から東へ、河口の位置を基準に並んでいる。島嶼部の河川は最下部に記載している。地形順の参考として一級水系（国土交通省管轄）も記載している。括弧内の水系名が一級水系。
愛媛県の二級水系一覧では、愛媛県を流れる水系のうち、愛媛県が管理する二級水系を記述する。2000年4月現在、181水系、408河川ある。 リストの順序は、河口の位置を基準に、香川県境から西へ並んでいる。島嶼の河川は末尾に記載している。地形順の参考として一級水系（国土交通省管轄）も記載している。括弧内の水系名が一級水系。
宮崎県の二級水系一覧（みやざきけんのにきゅうすいけいいちらん）では、宮崎県を流れる水系のうち、宮崎県が管理する二級水系を記述する。2006年11月1日現在、53水系、237河川ある。 リストの順序は、北から南に、河口の位置を基準にして並んでいる。地形順の参考として一級水系（国土交通省管轄）も記載している。括弧内の水系名が一級水系。
熊本県の二級水系一覧では、熊本県を流れる水系のうち、熊本県が管理する二級水系を記述する。2000年4月1日現在、81水系、148河川ある。 リストの順序は、北から南に、河口の位置を基準にして並んでいる。島嶼部の河川は末尾にまとめ、それぞれの島内で反時計回りに並んでいる。地形順の参考として一級水系
水系は斐伊川水系に編入されて二級水系としては消滅し、現在国土交通省が管理を行う二級水系は無い。 二級水系より重要な水系は一級水系とされ、原則として国の管理下におかれる。全国に109水系存在する（詳細は一級水系の項を参照）。また、一級水系、二級水系以外の水系は単独水系と呼ばれる。
一級河川の数は1万4062にのぼり、二級水系（2,711水系）に属する二級河川の総数 (7,080河川) より多い（2016年4月30日現在）。 2府県（北海道は2地域振興局）以上に跨る河川水系は一般的に一級水系だが、酒匂川水系・武庫川水系・錦川水系のように2都府県を跨いでも二級水系の例もあれば、梯川水系や土器川水系のように1県内完結かつ流域面積が500平方
鹿児島県の二級水系一覧では、鹿児島県を流れる水系のうち、鹿児島県が管理する二級水系を記述する。2013年現在160水系、310河川ある。 リストの順序は出水市から反時計回り・島嶼部の順に、河口の位置を基準にして並んでいる。地形順の参考として一級水系（国土交通省管轄）も記載している。括弧内の水系名が一級水系。 ^
北海道の二級水系一覧（ほっかいどうのにきゅうすいけいいちらん）では、北海道を流れる水系のうち、北海道が管理する二級水系を記述する。2012年現在、230水系、467河川ある。地形順の参考として一級水系（国土交通省管轄）も記載している。括弧内の水系名が一級水系。湖沼については、一級河川・二級河川としてカウントされるもののみ直接備考に示す。
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