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日本語では「古細菌」または「アーキア」が呼称されることが多い。「始原菌（しげんきん）」も使われる。「古細菌」という名称は、「菌」および「細菌」を名前に含むが、菌類（真菌）や細菌（真正細菌）とは異なる。 地球上の全ての生物は、細菌、古細菌、真核生物の3つのドメインのいずれかに分類される。細菌と古細菌
a（NCBI分類のタウム古細菌/Thaumarchaeotaに相当） コラルカエウム綱/Korarchaeia（NCBI分類のコル古細菌/Korarchaeotaに相当） バテュアルカエイア綱/Bathyarchaeia（NCBI分類のバテュ古細菌/Bathyarchaeotaに相当）
メタノバクテリウム綱/Methanobacteria メタノバクテリウム目/Methanobacteriales メタノバクテリウム科/Methanobacteriaceae - メタン生成菌。淡水系や動物の消化器官から分離例が多い。 メタノテルムス科/Methanothermaceae - メタン生成菌。超好熱性。
ナノ古細菌（ナノこさいきん、Nanoarchaeota、ナノアーキオータ）とは、2002年に提唱された古細菌の門である。クレン古細菌への寄生に特化したグループで、細胞・ゲノムサイズともに極端に小型化している。2022年にNanobdella aerobiophilaが記載された。
タウム古細菌（タウムアーキオータ、タウマルカエオタ、Thaumarchaeota、Thaumarchaea）は、2008年に提案された古細菌の門である。古細菌ではあるが極限環境微生物としての性格は薄く、16S rRNAクローンによる分布は海洋、土壌が中心である。 門名はギリシア語のΘαύμας（不思議な;
evolution of regulated actin dynamics via characterization of primitive gelsolin/cofilin proteins from Asgard archaea” (英語). Proceedings of the National
単細胞の微生物で， 核膜のない原核生物の一群。 球状・桿状・螺旋(ラセン)状などを呈し， 葉緑体・ミトコンドリアなどをもたない。 原則として二個に分裂してふえる。 動植物に対して病原性をもつものもあるが， 広く生態系の中にあって物質循環に重要な役割を果たしている。 分裂菌類。 バクテリア。
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